Yo pienso que es el CD de FT por lo que has descrito pero bueno, Te aconsejo que hagas lo siguiente pide prestado a alguien un CD de el Warcraft III:Frozen Throne y prueba si lo instala ya sabes que el problema es el CD de FT. Si tu piensas que es el Windows anda y pruebalo en otra maquina que este corriendo bajo Win98 o otro Windows.
La compactera queda descartada si el unico problema que tienes al instalar es con ese juego.

PD: Que lo hayas instalado anteriormente con ese mismo CD no te asegura en nada que no se haya rayado, caido y por consiguiente malogrado despues de la ultima vez que lo instalastes satisfactoriamente.