Re: Problemas con IIS 6.0
Realmente no hay una guia general o paso a paso de como configurar bien un IIS, todo depende de que servicios tengas corriendo sobre el mismo, lo mejor que vas a poder encontrar es un manual de buenas practicas.
Me imagino que ya has revisado el event log de tu servidor para tratar de aislar la causa, eso es lo primero que haria yo. Despues analizaria el consumo de memoria de tu servidor y trataria de aislar los pools de memoria para cada aplicacion.
Con respecto del monitoreo, puedes usar el perfmon de MS para revisar los contadores de performance de tu servidor web.
Re: Problemas con IIS 6.0
La verdad no conozco mucho sobre servidores asi que no tengo mucha practica en cuanto a revisar logs y esos temas, pero con lo que me has dicho voy a empaparme un poco para ver que encuentro.
Gracias!